羥甲基化DNA免疫沉淀測序(Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation Sequencing,hMeDIP-Seq),
是通過5hmC特異性抗體富集羥甲基化的DNA片段,結合NGS測序技術在全基因組水平上以較小的數據量,快速、高效地尋找羥甲基化區域;
可廣泛應用于羥甲基化與疾病關系研究以及羥甲基化在胚胎發育過程中的研究。
重點技術及質控,用心服務每一個項目
專注表觀組學10年,提供專業有價值的DNA羥甲基化完整解決方案;
較早開發羥甲基化測序技術的團隊,提供羥甲基化多種解決方案;
已完成人、小鼠、獼猴等多種物種的hMeDIP-seq項目經驗;
助力客戶在Clin Epigenetics等雜志發表多篇論文;
專業的生物信息分析團隊, 提供更多個性化分析思路和方案。
科學方案設計
從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析;
每個項目需要專業、有價值的建議;及時高效的溝通,以保障高質量研究成果。
樣本類型和要求
樣本類型 | 樣本要求 |
基因組DNA | 總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量 |
細胞、全血、動物組織等 | 按照送樣要求準備 |
備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸 |
數據分析
hMeDIP-seq | 分析內容 | 備注 | |
標準分析 | 1、測序數據質量評估 | 過濾掉低質量數據,保證數據質量 | |
2、與參考基因組比對 | 測序Reads 在基因組上的分布 | ||
3、5hmC Peak峰Calling | 5hmC富集區域鑒定 | ||
4、5hmCPeak圖譜分析 | 5hmCPeak在基因組,染色體,功能元件上的分布 | ||
6、組間差異5hmCPeak分析 | 尋找DhMR及注釋 | ||
7、差異5hmCPeak基因分析 | 相關基因GO,KEGG富集分析 | ||
高級分析 | 8、多組學整合關聯分析 | 例如與轉錄組關聯分析 | |
9、其它定制化分析 | 結合課題背景亮點挖掘 |
羥甲基化DNA免疫沉淀測序(Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation Sequencing,hMeDIP-Seq),
是通過5hmC特異性抗體富集羥甲基化的DNA片段,結合NGS測序技術在全基因組水平上以較小的數據量,快速、高效地尋找羥甲基化區域;
可廣泛應用于羥甲基化與疾病關系研究以及羥甲基化在胚胎發育過程中的研究。
重點技術及質控,用心服務每一個項目
專注表觀組學10年,提供專業有價值的DNA羥甲基化完整解決方案;
較早開發羥甲基化測序技術的團隊,提供羥甲基化多種解決方案;
已完成人、小鼠、獼猴等多種物種的hMeDIP-seq項目經驗;
助力客戶在Clin Epigenetics等雜志發表多篇論文;
專業的生物信息分析團隊, 提供更多個性化分析思路和方案。
科學方案設計
從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析;
每個項目需要專業、有價值的建議;及時高效的溝通,以保障高質量研究成果。
樣本類型和要求
樣本類型 | 樣本要求 |
基因組DNA | 總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量 |
細胞、全血、動物組織等 | 按照送樣要求準備 |
備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸 |
數據分析
hMeDIP-seq | 分析內容 | 備注 | |
標準分析 | 1、測序數據質量評估 | 過濾掉低質量數據,保證數據質量 | |
2、與參考基因組比對 | 測序Reads 在基因組上的分布 | ||
3、5hmC Peak峰Calling | 5hmC富集區域鑒定 | ||
4、5hmCPeak圖譜分析 | 5hmCPeak在基因組,染色體,功能元件上的分布 | ||
6、組間差異5hmCPeak分析 | 尋找DhMR及注釋 | ||
7、差異5hmCPeak基因分析 | 相關基因GO,KEGG富集分析 | ||
高級分析 | 8、多組學整合關聯分析 | 例如與轉錄組關聯分析 | |
9、其它定制化分析 | 結合課題背景亮點挖掘 |
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